Alamut Kalesi'nin düşüşü, Haşhaşiler için dönüm noktası olmuştur. Bu olay, sadece bir askeri yenilgi değil, aynı zamanda bir inanç ve varoluş mücadelesinin sona ermesi anlamına geliyordu. Moğol işgali, Haşhaşilerin tarih sahnesindeki etkisini büyük ölçüde azaltmış, onları dağılma sürecine sürüklemiş ve geçmişteki güçlerini yitirmelerine neden olmuştur.

Alamut Kalesi'nin yıkılışının Haşhaşiler üzerindeki etkileri şunlardır:

• Haşhaşiler dağıldı. Moğolların kalelerine girerek tüm Haşhaşileri öldürmesi sonucu tarikat dağıldı.
• Paralı suikast birliği haline geldiler. Haşhaşiler, bir paralı suikast birliğine dönüştü ve tarikat özelliğini büyük ölçüde yitirdi.
• Etkilerini kaybettiler. İçsel çatışmalar ve düşman baskıları sonucu bazı bölgelerde etkilerini kaybetmeleri, yenilikçi yöntemler geliştirmelerine neden oldu.

Alamut Kalesi, 1256 yılında, Bağdat İşgali'ne giden Hülâgû Han komutasındaki Moğol ordusu tarafından Haşhaşiler'i yok etmek amacıyla ele geçirilmiştir.