Akyatan Gölü, Türkiye'nin en önemli sulak alanlarından biri olarak, göçmen kuşların geçiş noktasıdır. Bu doğal habitat, farklı kuş türlerine ev sahipliği yapmanın yanı sıra, onların üreme ve kışlama dönemlerinde de hayati bir rol oynamaktadır. Göl, her yıl binlerce kuşun uğrak yeri olmaktadır ve bu durum, bölgedeki biyoçeşitliliği de zenginleştirmektedir.

Akyatan Gölü'nde bulunan bazı göçmen kuş türleri:

• Kıyı kuşları. Kılıçgaga, küçük cılıbıt, küçük kumkuşu, döğüşken kuş ve batak çulluğu.
• Ördek türleri. Yaz ördeği, turaç, sazhorozu, kocagöz.
• Flamingolar. Her yıl önemli bir kısmı İran'daki Urumiye Gölü'nden gelen 10.000'i aşkın flamingo.
• Diğer türler. Suna, fiyu, elmabaş patka, dikkuyruk, sakarmeke, gri balıkçıl, kervan çulluğu, tarakdiş, kaşıkçı, sumru, alaca yalıçapkını.

Akyatan Gölü, göçmen kuşlar için önemli bir barınma ve kışlama alanıdır.